冷凍干燥機普通型：物料散裝于物料盤中，適用于食品、中草藥、粉末材料的凍干。
壓蓋型：適合西林瓶裝物料的干燥，凍干準備時，按需要將物料分裝在西林瓶中，浮蓋好瓶蓋后進行冷凍干燥，干燥結束后操作壓蓋機構壓緊瓶蓋，可避免二次污染、重新吸附水分，易于長期保存。
多歧管型（掛瓶型）：在干燥室外部接裝燒瓶，對旋凍在瓶內壁的物料進行干燥，這時燒瓶作為容器接在干燥箱外的歧管上，燒瓶中的物料靠室溫加熱，通過多歧管開關裝置，可按需要隨時取下或裝上燒瓶，不需要停機。
如果冷凍干燥機不制冷怎么解決?不制冷就意味著無法正常工作，更不能去除水份，等于沒有開機一樣，這是什么原因造成的?這首先檢查冷凝器的散熱情況，一般風冷式冷凝器應經常清洗散熱鋁片。散熱鋁片起著重要的散熱作用。還要檢查冷媒是不是足夠，看壓力表情況。
冷凍干燥機工作結束操作流程
①將冷凍干燥機的快速充氣閥打開，同時關“真空泵”電源開關，使空氣緩緩進入冷肼;如需充入惰性氣體，則將惰性氣體的減壓導管連接“充氣口”;
②關閉冷凍干燥機的“真空鍵”、“制冷鍵”，如長期不用應拔掉電源線;
③提起有機玻璃罩，將物品取出，保存，冷凍干燥結束;
④冷阱中的冰化成水后，需將水從快速充氣閥口排除，操作與充氣相似;（如有除霜功能的，按除霜鍵，加速溶解。
⑤清理冷阱中的水分和雜質，妥善保養設備;
⑥多歧管型，應逐個關閉橡膠閥并取下凍干瓶后再重復關機操作。